潔凈室是用經過三級過濾（初、中、高）的潔凈空氣來稀釋室內被污染的空氣或利用活塞效應應用潔凈空氣把被污染的空氣擠壓出潔凈室的方法而達到不同潔凈度的，因此潔凈空調系統的風量是保證達到潔凈度的關鍵。風量計算主要考慮以下因素：
1、非單向流潔凈室一般適用于6，7, 8, 9級（也就是原美國聯邦標準FS-209E的千級、萬級、十萬級），潔凈度要求不高的潔凈室是用稀釋的方式來達到一定的潔凈度，所需的風量相應較小，送風量的取值一般以每小時換氣次數來決定，同時還需校核消除冷熱負荷所需的送風量。 
2、單向流的潔凈室的風量是以潔凈室斷面氣流流速來確定的。這里必須說明的是下限和上限的數值是一個合理的取值范圍，要避免認為斷面風速越高潔凈度級別越高的觀點。潔凈度級別的高低還與過濾器的過濾效率有關，和過濾粒子的粒徑有關，不要一味追求過高的斷面風速和大風量。 
3、潔凈室工作區的氣流流速還應滿足生產工藝和室內工作人員健康的要求。 
4、潔凈室空調系統新風量的確定。潔凈室空調系統的新風量是補償潔凈室內工藝排風的風量和維持正壓值得風量之和，同時還要保證供給潔凈室內每人每小時不小于40m3的新風量，經上述兩項計算取zui大值。但是這里必須強調潔凈空調系統新風量的需求要比普通空調系統大，除了滿足上述的要求外一定要嚴格控制新風量，因新風處理所需要的能耗很大，嚴格控制新風量是潔凈空調系統的一項重要節能措施。